腎移植に関する医療費は健康保険の適用となります。自己負担分は下記のような制度により自己負担が大幅に軽減されます。またドナーの医療費はレシピエントの健康保険で支払われるためほとんど負担はありません。

※障害者医療費助成制度	身体障害者手帳の所持者が対象、医療費全般が無料となる （ただし所得や手帳の等級によっては無料とならない市町村もある）
※更生医療	身体障害者手帳の所持者が対象、移植に係る費用や術後の免疫抑制剤の費用が0～2万円となる
※特定疾病療養制度	透析患者が対象、移植に係る必要が1～2万円となる